中国中医科学院中药研究所始建于1955年，是我国最早成立的一所中药研究国家级专门机构，自1983年起被确认为世界卫生组织传统医学合作中心。
中药研究所屠呦呦研究员由于发现青蒿素2011年被授予拉斯克临床医学研究奖，2015年获得诺贝尔生理学或医学奖，2016年获得国家最高科学技术奖，2019年获得“共和国勋章”。“胸怀祖国、敢于担当，团结协作、传承创新，情系苍生、淡泊名利，增强自信、勇攀高峰”的青蒿素精神，不仅是以屠呦呦研究员为代表的一代代中医药工作者精神特质的高度凝练，更是中医药行业共同的精神引领和价值追求。
中药研究所拥有道地药材品质保障与资源持续利用全国重点实验室、中药质量控制技术国家工程实验室。拥有本草学、临床中药学、中药资源学、中药资源生态学、分子生药学、中药鉴定学、中药化学、中药化学生物学、中药分析学、中药药剂学、中药药理学、中药毒理学等12个国家中医药管理局高水平重点学科及国家级传承基地—中药炮制学。设有16个研究中心。拥有中国中医科学院中药资源中心、中国中医科学院青蒿素研究中心2个挂靠管理单位。构建了完善的中药基础和应用基础研究、中药新药研发的研究体系和技术平台。
设有中药学硕士研究生、博士研究生培养点，是中国中医科学院博士后科研流动站的培养单位。
